L'équipe de « SOKO Hamburg » est dirigée par le commissaire principal Jan Köhler (Mirko Lang) – un chef malgré lui, qui dirige son commissariat depuis la rue plutôt que de moisir dans la hiérarchie administrative. Avec la commissaire principale ambitieuse Lena Testorp (Anna von Haebler), il forme un duo de direction opposé mais parfaitement harmonisé. L'équipe est renforcée par Oskar Schütz (Marek Erhardt), le policier le plus expérimenté du commissariat : un « flic instinctif » et solitaire. Cem Aladag (Arnel Taci), quant à lui, est une encyclopédie Wikipedia ambulante, dont l'outil le plus important est son smartphone, qu'il peut dégainer plus vite que d'autres leur arme. Avec Maria Gundlach (Katrin Angerer), il forme le cœur du poste et maintient l'unité en arrière-plan.
Les affaires de « SOKO Hamburg » s'étendent de Ratzeburg à St. Pauli, du port de Hambourg et de l'Altes Land jusqu'à Kehdingen et Dithmarschen. Le commissariat ne se trouve pas dans un nouvel immeuble chic à Hafencity, mais dans un ancien bâtiment en briques à la périphérie de Finkenwerder – directement sur l'Elbe. De plus, les commissaires ont à leur disposition à tout moment un bateau rapide, avec lequel ils peuvent atteindre les lieux du crime le plus rapidement possible en passant par l'Elbe.